Kecamatan Sekar merupakan kecamatan yang berbatasan langsung dengan kabupaten Ngawi, Madiun dan Nganjuk secara geografis berada di sisi Barat Daya dari Ibukota Kabupaten. Sebagian wilayahnya berupa kawasan hutan dan secara umum wilayah kecamatan Sekar berada pada ketinggian 300 sd 897 m diatas permukaan laut.
Adapun jarak dengan usat Pemerintahan Kabupaten Bojonegoro + 58 km,adapun Batas Wilayah sebagai berikut :Di sebelah Utara : Kecamatan Ngasem, BubulanDi sebelah Selatan : Kabupaten Ngawi, Kabupaten Madiun, Kabupaten Nganjuk
Di sebelah Timur : Kecamatan Gondang, Kabupaten Nganjuk
Di sebelah Barat : Kecamatan Ngambon, Tambakrejo, Kabupaten Ngawi
Luas wilayah Kecamatan Margomulyo tercatat : 13.107,64 Haterbagi menjadi 6 Desa dan 35 dusun